relief算法的代码实现

relief

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%
% 函数名：choose
% 函数介绍：选出分类权重大于阈值的基因，输出他们的原始表达量。和基因的顺序号。
% 输入参数： w是所有基因的分类权重向量。
%           m是原始基因表达谱数据中总的基因个数。
%           data是原始基因表达谱数据。数据的首行是样本类别标记行。0表示一类样本。1表示另一类样本。
%           stand_data是原始基因表达谱数据的归一化表达量。样本标记行已经去掉了。
% 输出参数：data_important是分类权重大于阈值的基因的原始表达量。
%          order是分类权重大于阈值的基因的顺序号。
%          w_important是选出的权重较大基因的权重。
%          stand_dataimportant是分类权重大于阈值的基因的归一化表达量。
%==========================================================================
function [data_important order w_important stand_dataimportant ] = choose （ w m data stand_data ）

%去掉样本标记行。
gene_data = data （ 2 : m + 1  : ）;

%设定基因权重阈值。
w_threshold = input （‘请输入基因权重阈值：‘）;

p = 1;

for i = 1 : m
    
    if w （ i ） > w_threshold              
        data_important （ p  :） = gene_data （ i : ）;%分类权重较大基因的原始表达量。
        stand_dataimportant （ p  :） = stand_data （ i  :）;%分类权重较大基因的归一化表达量。
        order （ p ） = i;
        w_important （ p ） = w （ i ）;
        p = p + 1;
    end
    
end
%end

 属性            大小     日期    时间   名称
----------- ---------  ---------- -----  ----
     目录           0  2016-07-22 18:09  Relief特征选择\
     文件        1372  2016-07-20 14:06  Relief特征选择\choose.m
     目录           0  2016-07-18 16:44  Relief特征选择\data_result\
     文件       11713  2007-06-01 18:02  Relief特征选择\data_result\feature_gene59.mat
     文件         275  2007-05-31 17:02  Relief特征选择\data_result\feature_order59.mat
     文件       22036  2007-05-31 16:17  Relief特征选择\data_result\gastric1519.fig
     文件     1134592  2007-05-22 12:19  Relief特征选择\data_result\gastric_cancer1519.xls
     文件       21592  2007-06-01 18:01  Relief特征选择\data_result\important_data112.mat
     文件         409  2007-05-31 17:01  Relief特征选择\data_result\important_order112.mat
     文件         177  2007-05-22 13:01  Relief特征选择\data_result\数据说明.txt
     文件        1867  2016-07-22 11:18  Relief特征选择\distant.m
     文件         641  2007-05-14 19:19  Relief特征选择\dot_weight.m
     文件     1134592  2007-05-22 12:19  Relief特征选择\gastric_cancer1519.xls
     文件         868  2007-05-15 15:28  Relief特征选择\hight.m
     文件        1030  2007-05-15 15:27  Relief特征选择\pillar.m
     文件        2068  2016-07-22 17:28  Relief特征选择\redundance.m
     文件        3595  2016-07-20 18:16  Relief特征选择\Relief.m
     文件         749  2007-05-15 15:31  Relief特征选择\sharp_jump.m
     文件        1119  2016-07-20 15:22  Relief特征选择\standardization.m
     文件        1678  2016-07-22 11:18  Relief特征选择\weighted.m